يعاني الدوري المصري من أزمات كثيرة تخص التحكيم وذلك بعد الانتهاء من خوض الجولة الثانية في ظل وجود العديد من الحالات الجدلية والتي يختلف خبراء التحكيم في تفسيرها وتحليلاها.
واستمرت حالة الجدل التحكيمي للأسبوع الثاني على التوالي وذلك على النحو التالي:
ظهر في مباراة الأهلي وزد الاعتراض على أحقية زد في الحصول على ضربة جزاء.
يأتي ذلك بجانب مباراة سموحة ومدى أحقية سموحة في الحصول على ضربة جزاء بجانب طرد عمر جابر وشكوك في هدف مصطفى شلبي الثاني للزمالك.
وشهدت مباراة الإسماعيلي وسيراميكا مطالبة الدارويش الحصول على ضربة جزاء.
وبشكل عام تم احتساب 9 ضربات جزاء في الجولتين بمعدل 5,% ضربة في كل مباراة وأحرزت 7 ضربات وأهدرت ضربتين.