أصبح باهر المحمدي، قلب دفاع فريق الإسماعيلي، والمنتخب الوطني، في ورطة، بسبب أداءه المتواضع في مباراة المنتخب الوطني أمام أوغندي، والتي انتهت بفوز الفراعنة بنتيجة هدفين دون رد، في إطار مباريات الجولة الثالثة والأخيرة من دور المجموعات من نهائيات كأس الأمم الأفريقية 2019، والتي تستضيفها مصر.
وبات المحمدي في ورطة، بعدما علق المكسيكي، خافيير أجيري، المدير الفني للفراعنة، على كثرة أخطاء المدافع في مباراة أوغندي، الأمر الذي ينبئ بعدم الاعتماد عليه مجددًا في باقي مباريات البطولة.
باهر المحمدي كان يُخطط للظهور بشكل متميز، للاستمرار في التشكيلة الأساسية، والتألق في البطولة، خاصة وانه تحدث مع أكثر من شركة تسويق قبل انطلاق الكان، لتسويقه وتوفير عرض أوروبي تمهيدًا لخوض تجربة الإحتراف، والرحيل عن ناديه خلال الميركاتو الصيفي المقبل.